Победа над гигантской Гауна дорого обошлась защитникам «Сидонии» — при спасении Юхаты сильно пострадала Идзана. Вместе со своими друзьями — Нагатэ, Юхатой и Цумуги — она пытается прийти в себя после произошедшего. Но мирное течение жизни нарушает катастрофа на поверхности «Сидонии». Неужели коварные замыслы Отиая уже претворяются в жизнь?..